Naslov PRIMJENA SEKVENCIRANJA CIJELOG EGZOMA U
ISTRAŽIVANJU GENETIČKE OSNOVE PARKINSONOVE
BOLESTI
Naslov (engleski) APPLICATION OF WHOLE-EXOME SEQUENCING IN GENETIC
RESEARCH OF PARKINSON’S DISEASE
Autor Valentino Rački
Mentor Vladimira Vuletić (mentor)
Član povjerenstva David Bonifačić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstva Marija Heffer (član povjerenstva)
Član povjerenstva Nina Pereza (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj Sveučilište u Rijeci Medicinski fakultet Rijeka
Datum i država obrane 2024-01-22, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO Kliničke medicinske znanosti Neurologija
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO Temeljne medicinske znanosti Genetika, genomika i proteomika čovjeka
Univerzalna decimalna klasifikacija (UDC ) 61 - Medicina
Predmetni sustav (MESH - Medical Subject Headings )
PARKINSONOVA BOLEST
genetics
Sažetak Ciljevi istraživanja: Parkinsonova bolest je česti neurodegenerativni poremećaj koji
zahvaća do 1% populacije iznad 65 godina, uz predviđanja postepenog porasta
prevalencije do 2% u idućih nekoliko desetljeća. Genetska osnova bolesti se može
pronaći kod 15% do 30% pacijenata, uz sve rastući broj zahvaljujući novim tehnologijama
sekvenciranja. U dosadašnjim istraživanjima nije bila zastupljena južnoslavenska
populacija, te je specifični cilj ovog istraživanja utvrditi učestalost poznatih genetičkih
varijanti kod hrvatskih pacijenata.
Materijali i metode: Uključni kriteriji za ispitivanje su potvrđena Parkinsonova bolest,
koristeći najrelevatnije kliničke dijagnostičke kriterije. Svi ispitanici su dali informirani
pristanak i ispunili genetski upitnik prije uzorkovanja krvi te su bili podijeljeni u tri grupe
ovisno o vrsti nastanka (rani, obiteljski i sporadični) Postupak sekvenciranja cijelog
egzoma se učinio po dosadašnjim primjerima dobre prakse.
Rezultati: 152 pacijenta su uključena u ispitivanje. Kod ukupne kohorte je otkriveno 14
uzročnih mutacija po kriterijima proglašenim kao patogene i vjerojatno patogene (GBA,
n=11; PRKN, n=2; ITM2B n=1). Nadalje, u cijeloj kohorti od 152 pacijenata, njih 41 je
imalo barem jednu varijantu nejasnog značaja (n=41, 26,97%). Patogene su bile prisutne
u svim grupama, uz razlike u učestalosti: rani nastup - 12,2%, obiteljski nastup - 12,5%,
sporadični nastup - 5,63%. Kod varijanti nejasnog značaja bila sljedeća učestalost unutar
grupa: rani nastup – 29,27%, obiteljski nastup - 15%, sporadični nastup – 32,39%
Zaključak: Sekvenciranje cijelog egzoma ima primjenu u istraživanju genetske osnove
Parkinsonove bolesti. Patogene varijante su pronađene u sve tri skupine ispitanika,
najčešće u GBA genu, što odgovara dosadašnjim spoznajama za europske populacije.
Uz to, otkriveno je nekoliko varijanti nejasnog značaja, koje zahtijevaju daljnju analizu.
Ovakav pristup ima i istraživačku i kliničku vrijednost, te se omogućuje individualno
predviđanje specifičnih faktora rizika.
Sažetak (engleski) Research objectives: Parkinson's disease is a common neurodegenerative disorder that
affects up to 1% of the population over 65 years of age, with predictions of a gradual
increase in prevalence up to 2% in the next few decades. The genetic basis of the disease
can be found in 15% to 30% of patients, with the number increasing thanks to new
sequencing technologies. In previous research, the South Slavic population was not
represented, so the specific goal of this research is to determine the frequency of known
genetic variants in Croatian patients.
Materials and methods: Inclusion criteria for the trial were confirmed Parkinson's
disease, using the most relevant clinical diagnostic criteria. All subjects gave informed
consent and filled out a genetic questionnaire before blood sampling and were divided
into three groups depending on the type of origin (early, familial, and sporadic). The entire
exome sequencing procedure was done according to established methods.
Results: 152 patients were included in the study. In the total cohort, 14 causative
mutations were detected according to the criteria declared as pathogenic and probably
pathogenic (GBA, n=11; PRKN, n=2; ITM2B n=1). Furthermore, in the entire cohort of
152 patients, 41 of them had at least one variant of unclear significance (n=41, 26.97%).
Pathogens were present in all groups, with differences in frequency: early onset - 12.2%,
familial onset - 12.5%, sporadic onset - 5.63%. For variants of unclear significance, the
frequency within the groups was as follows: early onset - 29.27%, familial onset - 15%,
sporadic onset - 32.39%
Conclusion: Whole-exome sequencing has applications in research into the genetic
basis of Parkinson's disease. Pathogenic variants were found in all three groups of
subjects, most often in the GBA gene, which corresponds to current knowledge for
European populations. In addition, several interesting variants of unclear significance
were discovered, which require further analysis. This approach has both research and
clinical value since individual prediction of specific risk factors is possible.
Ključne riječi
Parkinsonova bolest
sekvenciranje cijelog egzoma
genetika poremećaja pokreta.
Ključne riječi (engleski)
Parkinson's disease
whole exome sequencing
genetics of movement disorder
Jezik hrvatski
URN:NBN urn:nbn:hr:184:837076
Datum promocije 2024
Projekt Šifra: IP-2019-04-7276 Naziv: Epidemiologija Parkinsonove bolesti u Hrvatskoj i utjecaj genetskih čimbenika i mikrobiote na progresiju bolesti i ishod liječenja Kratica: GiOPARK Voditelj: Vladimira Vuletić Pravna nadležnost: Hrvatska Financijer: Hrvatska zaklada za znanost Linija financiranja: Research Projects
Projekt Šifra: uniri-biomed-18-198 Naziv: Genetska epidemiologija Parkinsonove bolesti u Hrvatskoj Naziv: Genetic epidemiology of Parkinson's disease in Croatia Voditelj: Vladimira Vuletić Pravna nadležnost: Hrvatska Financijer: Sveučilište u Rijeci
Studijski program Naziv: Biomedicina Vrsta studija: sveučilišni Stupanj studija: poslijediplomski doktorski Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstvo (dr.sc)
URL zapisa u katalogu https://libraries.uniri.hr/cgi-bin/lb02/unilib.cgi?form=610000000199990&id=0880489003
Vrsta resursa Tekst
Način izrade datoteke Izvorno digitalna
Prava pristupa Pristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenja
Datum i vrijeme pohrane 2024-05-03 07:12:49