Biofilm se definira kao nakupina mikroorganizama i njihovih izvanstaničnih produkata koji zajedno tvore funkcionalnu zajednicu priljubljenu za određenu površinu. Mokraćna infekcija je infekcija bilo kojeg dijela mokraćnog sustava. Biofilm se može formirati na tjelesnom tkivu pacijenata (npr. urotel), ali vrlo često nastaje na stranim tijelima kao što su urinarni kateteri ili razni urološki implantati. Nastanak biofilma je složen proces koji se sastoji od nekoliko reverzibilnih i ireverzibilnih koraka. Biofilm je uobičajeno građen od bakterija (najčešće E.coli). Jedan od najvažnijih strukturalnih dijelova biofilma je ekstracelularni matriks. Osim akutnih, biofilm se povezuje kao uzročnik kroničnih i rekurentnih infekcija mokraćnog sustava. Postavljanje dijagnoze mokraćne infekcije uzrokovane biofilmom sastoji se od uzimanja anamneze, promatranja kliničke slike, fizikalnog pregleda i uzimanja uzoraka urina. Kriteriji za postavljanje dijagnoze nazivaju se Parsek-Singhovi kriteriji. Biofilm je često uzročnih infekcija koje pokazuju zavidan stupanj antibiotske rezistencije. Prevencija nastanka biofilma provodi se poštivanjem mjera asepse, upotrebe hidrogela, nanočestica, antiadhezijskih molekula, liposoma i enzimskih inhibitora. Liječenje se sastoji od antibiotske terapije kao i od kirurške zamjene određenog implantata ako se on smatra sijelom biofilma.